首先，需要明確的是，新電子稅局的報稅系統現在具備了一項新的功能，即能夠自動將印花稅與當期企業增值稅進銷項發票金額進行比對。一旦發現這兩者之間存在顯著的差異，且偏離值超過了500的界限，系統便會自動發出預警信號。

然而，這并不意味著企業就存在偷稅漏稅的行為。相反，這更像是一種自我檢查的提醒機制，旨在確保企業計稅依據的真實性和準確性。因此，在收到此類提示時，企業應首先進行自我核查，確認計稅依據是否確實無誤。只有在確認無誤后，方可繼續進行申報流程。

那么，在進行自我核查的過程中，我們應該如何確認印花稅是否準確無誤呢？

印花稅，作為一種行為稅，其特點在于對合同雙方都需要進行課稅。以買賣合同為例，對于買方而言，該合同屬于采購合同，需要按規定繳納印花稅；而對于賣方而言，該合同則屬于銷售合同，同樣需要繳納相應的印花稅。

這一規定并非意味著重復納稅，而是印花稅制度的獨特之處。因此，企業在簽訂采購合同時，也需要充分考慮到印花稅的因素。

在申報印花稅的過程中，如果發現計稅基數與進銷項發票金額存在不一致的情況，可以從以下幾個方面進行原因剖析：

時間性差異：企業若按照合同簽署日期進行印花稅的申報繳納，那么由于合同簽訂時間和實際執行時間可能存在的差異，便會導致計稅基數與發票金額之間的不匹配。此時，關鍵在于確保所有列舉范圍內的憑證均已按規定進行申報繳稅。

征稅范圍的不同：自2022年7月1日起正式實施的新印花稅法采取的是列舉制度。這意味著，不在明確列舉范圍內的憑證是無需繳納印花稅的。

因此，在申報印花稅時，企業需明確區分應稅合同與非應稅合同，以避免不必要的稅務風險。

無票業務的影響：在實際經營過程中，企業可能會遇到無票收入或購進等業務情形。這些無票業務同樣會導致印花稅計稅基數與進銷項發票金額之間存在差異。因此，在申報印花稅時，企業需要充分考慮并合理調整這部分業務對計稅基數的影響。

稅收優惠政策的利用：為了減輕企業稅收負擔，國家出臺了一系列印花稅相關的稅收優惠政策。

這些稅收優惠政策的利用，也可能會導致印花稅計稅基數與發票金額之間存在差異。因此，在申報過程中，企業應確保正確選擇和運用相關稅收優惠政策，以降低稅務風險并合理節稅。

值得一提的是，暢捷通好會計為您提供了便捷的稅務解決方案，能根據發票數據自動測算印花稅金額，并實時更新財稅政策，自動生成納稅申報表。此外，其結賬功能還內置了36項風險指標和各行業稅負率，助您實時監控稅負波動，輕松應對稅務風險。

總之，印花稅申報是一項復雜而細致的工作，需要企業充分理解稅法規定并合理運用相關稅收政策。面對印花稅計稅偏離預警提示時，企業應保持冷靜并逐一排查差異原因，以確保計稅依據的真實性和準確性從而規避潛在的稅務風險。